１、本次活动事先没有作详细的攀登计划和撤营计划，原因是多方面的，一是事先对山上的情况不熟悉，二是队员来源广泛，不能掌握每位队员的心理素质和体能特点。对气候的变化也缺乏规律性的认识。撤营计划到登山后期才作安排，显得这次登山在一些环节上没有周密的计划，随意性较大。
　　２、由于慕士塔格山体庞大，超短波通讯有多处死角，尤其攀登路线C1以上无线电通讯不畅，除C1外，各营地间与大本营间无法联系。攀登途中产生的多种变化都无法相互通报，给总体调度指挥带来了很大的麻烦。张教授根据1997年的经验，曾经设想在冰川北侧江不拉克附近建一个中继通讯点，用来改善通讯状况。但由于病员较多，战线很长，人手不够用，加之跨越冰川建点必须派遣经验丰富的队员，这将削弱主力队伍。因此，该建议未能实现。这也是整个登山过程杂乱无序的原因之一。
　　３、本次活动的协调还存在一些问题。由于队员来自不同的地方，各方代表都有强烈的冲顶愿望，组织者几乎无法决定让谁登或不让谁登。加之无线电通讯不畅，在二号营地以上，大本营与队员基本失去联系，无法实现有效地控制协调。形成了部分队员各自为战，单独行动的条件，对生存构成很大的威胁。在6名试图登顶的队员中，有3名都是独自一人实行突击，冒着极大的风险。这是多方联合登山中应该着重吸取的教训。
　　４、对队员的心理素质和体能特点掌握不够，甚至过高地估计了队员的能力。新疆工学院学生王海角从C1到C1.5建营时就显得体力不支，他本人下撤到BC后给其它队员讲，他不再想登山了。而领队张耀东认为王海角是校篮球队主力队员，在本院三名队员中年龄最青，体能应该不成问题。便以提高心理承受能力为愿望，经做思想工作后，派其继续攀登。在到达C3时身体已出现明显不适的情况下，队长又继续让他留在营地伺机登顶，错过了自救的时机，导致他在C3营地险些遇难。
　　５、高山食品还欠研究，虽然花了不少钱，买了不少精美小吃，但在高海拔地区和高度疲劳状态下，这些食品无法引起食欲，客观上造成进食困难。部分队员主观强制进食的意志力差，也造成体能降低。这些剩余食品虽经掩埋，但还是给环境造成了污染。在C1.5营地，由于一时疏忽，将高山食品袋放在帐篷外，招致高山乌鸦的毁坏，也造成了一定的食品损失和环境污染。
　　６、5700米冰谷地区C1.5营地的建营位置是否含有隐患？当地东西向谷深80米，宽度约120米，坡度70度至30度不等，两侧上方分布有几十米雪层、冰瀑和断裂带。在地震、冰裂或其它因素的诱发下，营地直接遭受冲击的可能性还是存在的。今后应该充分注意选址的安全性。